Bioinformaticien — pipelines NGS et génomique clinique
Bioinformaticien avec un doctorat en génomique computationnelle et six ans d’expérience en plateforme de séquençage hospitalo-universitaire. Je maîtrise les pipelines NGS (alignement, variant calling, annotation), Python/R, conteneurisation et dépôt de données sur serveurs sécurisés. J’ai industrialisé des workflows pour réduire les délais de rendu, documenté les procédures qualité et accompagné biologistes et cliniciens sur l’interprétation des résultats. Sens de la rigueur, respect des cadres RGPD et HDS, et capacité à vulgariser auprès d’équipes non informaticiennes : je recherche un poste où la bioinformatique soutient la recherche translationnelle et la médecine de précision dans un environnement Linux/HPC structuré.
Expérience professionnelle
Bioinformaticien · CHU Rangueil · Toulouse
2020 — aujourd’hui
- Industrialisation workflows exome et RNA-seq pour 3 500 échantillons/an.
- Réduction délai rendu de 30 % via parallélisation et conteneurs.
Ingénieur bioinfo · Biotech SeqNova · Lyon
2018 — 2020
- Développement scripts QC et rapports automatisés.
Formation
Doctorat bioinformatique — Université Toulouse III (2018)
Compétences
- Python, R, Linux, Git, Snakemake
- Annotation variants, bases publiques
Qualités
- Rigueur
- Esprit d’équipe
- Pédagogie
Langues
- Français : natif
- Anglais : courant scientifique
Centres d’intérêt
- Contributions open source
- Course à pied